MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_4

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014543	TGG	2	6	34	39	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307950759
2	NC_014543	GTTC	2	8	67	74	0 %	50 %	25 %	25 %	307950759
3	NC_014543	GGC	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307950759
4	NC_014543	TTGA	2	8	130	137	25 %	50 %	25 %	0 %	307950759
5	NC_014543	GACT	2	8	182	189	25 %	25 %	25 %	25 %	307950759
6	NC_014543	GCC	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307950759
7	NC_014543	AGAT	2	8	251	258	50 %	25 %	25 %	0 %	307950759
8	NC_014543	AG	3	6	259	264	50 %	0 %	50 %	0 %	307950759
9	NC_014543	TGTT	2	8	266	273	0 %	75 %	25 %	0 %	307950759
10	NC_014543	ATG	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307950759
11	NC_014543	A	6	6	343	348	100 %	0 %	0 %	0 %	307950759
12	NC_014543	ATA	2	6	434	439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950759
13	NC_014543	TGTAC	2	10	513	522	20 %	40 %	20 %	20 %	307950759
14	NC_014543	AGA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950759
15	NC_014543	AG	3	6	559	564	50 %	0 %	50 %	0 %	307950759
16	NC_014543	AAT	2	6	579	584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950759
17	NC_014543	A	6	6	701	706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014543	ATGA	2	8	751	758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014543	A	7	7	884	890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014543	CGC	2	6	898	903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014543	AGC	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014543	ATG	2	6	925	930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014543	T	6	6	931	936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014543	ACC	2	6	952	957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014543	T	6	6	1004	1009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014543	AG	3	6	1021	1026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014543	CT	3	6	1050	1055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014543	ATT	2	6	1152	1157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014543	CTGCA	2	10	1203	1212	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014543	ATT	2	6	1218	1223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014543	A	7	7	1257	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014543	CAGGA	2	10	1264	1273	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014543	GCT	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014543	C	6	6	1330	1335	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_014543	AAC	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014543	AACA	2	8	1370	1377	75 %	0 %	0 %	25 %	307950760
37	NC_014543	ACA	3	9	1375	1383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307950760
38	NC_014543	CGA	2	6	1459	1464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307950760
39	NC_014543	GAA	2	6	1502	1507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950760
40	NC_014543	GCA	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014543	GCG	2	6	1849	1854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014543	CA	3	6	1868	1873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014543	CAA	2	6	1932	1937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014543	GCCGC	2	10	1957	1966	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_014543	C	6	6	1989	1994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_014543	TG	3	6	2224	2229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014543	C	6	6	2236	2241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_014543	GCA	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014543	CTC	2	6	2412	2417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014543	CCGC	2	8	2470	2477	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_014543	T	6	6	2486	2491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014543	CAC	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014543	AAAT	2	8	2618	2625	75 %	25 %	0 %	0 %	307950761
54	NC_014543	TAA	2	6	2646	2651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950761
55	NC_014543	AT	5	10	2677	2686	50 %	50 %	0 %	0 %	307950761
56	NC_014543	AT	3	6	2710	2715	50 %	50 %	0 %	0 %	307950761
57	NC_014543	CAA	2	6	2725	2730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307950761
58	NC_014543	AAG	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950761
59	NC_014543	TGG	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307950761
60	NC_014543	CATA	2	8	2841	2848	50 %	25 %	0 %	25 %	307950761
61	NC_014543	AGA	2	6	2866	2871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307950761
62	NC_014543	GAAT	2	8	2877	2884	50 %	25 %	25 %	0 %	307950761
63	NC_014543	A	8	8	2890	2897	100 %	0 %	0 %	0 %	307950761
64	NC_014543	AAT	2	6	2919	2924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950761
65	NC_014543	ATG	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307950761
66	NC_014543	CAT	2	6	2940	2945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307950761
67	NC_014543	CA	4	8	2948	2955	50 %	0 %	0 %	50 %	307950761
68	NC_014543	TAGA	2	8	3065	3072	50 %	25 %	25 %	0 %	307950761
69	NC_014543	A	6	6	3218	3223	100 %	0 %	0 %	0 %	307950761
70	NC_014543	AAT	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307950761
71	NC_014543	AGATG	2	10	3372	3381	40 %	20 %	40 %	0 %	307950761
72	NC_014543	CTG	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307950761
73	NC_014543	CAA	2	6	3453	3458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307950761
74	NC_014543	CAT	3	9	3643	3651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014543	CCA	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014543	A	6	6	3720	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014543	CA	3	6	3726	3731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014543	ATTTAC	2	12	3773	3784	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014543	A	6	6	3790	3795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014543	CAT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014543	AGC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014543	TAA	2	6	3873	3878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014543	TA	3	6	3882	3887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014543	ACA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014543	GGA	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014543	CAA	2	6	3940	3945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014543	TGT	2	6	3991	3996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014543	ATA	2	6	4028	4033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014543	TC	3	6	4046	4051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.